个人简介
童信凯，讲师，生于1994年，2021年博士毕业于猪遗传改良与种质创新全国重点实验室（江西农业大学），师从黄路生院士。前期主要以猪为研究对象，通过生物信息学大数据处理，聚焦于（1）猪肺部病变的分子遗传机制解析；（2）全球猪种单倍型构建、基因型填充、GWAS、基因组选择、群体结构分析、平衡及正向选择分析；（3）全长转录组分析、5mC甲基化和基因家族分析。相关研究结果以第一作者发表在Nature Communications（2023，IF=16.6）和Science China Life Sciences（2021，IF=10.2）期刊，以共同作者发表在Nature（2022），Zoological Research（2022），Genetics Selection Evolution（2021），Microbial biotechnology（2019）和Evolutionary applications等期刊。未来计划通过生物信息学鉴定影响复杂性状的关键基因，并结合实验验证深入解析其功能及分子机制。
研究方向
整合基因组、转录组、表观组等多组学技术解析动物复杂性状。
以果蝇为研究材料，探究器官大小维持的分子机制。
通过大数据处理和生物信息学挖掘关键基因对Hippo通路和肿瘤发生发展的影响。
代表性论文
Tong Xinkai#; Chen Dong; Hu Jianchao; Lin Shiyao; Ling Ziqi; Ai Huashui; Zhang Zhiyan; Huang Lusheng; Accurate haplotype construction and detection of selection signatures enabled by high quality pig genome sequences, Nature Communications, 2023, 14(1): 5126.
Tong Xinkai#; Huang Tao; Zhang Mingpeng; Chen Jiaqi; Zhang Zhou; Li Jingquan; Du Huipeng; Ling Ziqi; Wu Zhongzi; Yang Bin; Xiao Shijun; Ai Huashui; Four genetic loci affecting swine lung lesions identified by whole-genome sequencing-based association studies, Science China Life Sciences, 2021, 64(9): 1571-1574.
Yang Hui; Wu Jinyuan; Huang Xiaochang; Zhou Yunyan; Zhang Yifeng; Liu Min; Liu Qin; Ke Shanlin; He Maozhang; Fu Hao; Fang Shaoming; Xiong Xinwei; Jiang Hui; Chen Zhe; Wu Zhongzi; Gong Huanfa; Tong Xinkai; Huang Yizhong; Ma Junwu; Gao Jun; Charlier Carole; Coppieters Wouter; Shagam Lev; Zhang Zhiyan; Ai Huashui; Yang Bin; Georges Michel; Chen Congying; Huang Lusheng; ABO genotype alters the gut microbiota by regulating GalNAc levels in pigs, Nature, 2022, 606(7913): 358-367.
Wu Zhongzi; Gong Huanfa; Zhang Mingpeng; Tong Xinkai; Ai Huashui; Xiao Shijun; PerezEnciso Miguel; Yang Bin; Huang Lusheng; A worldwide map of swine short tandem repeats and their associations with evolutionary and environmental adaptations, Genetics Selection Evolution, 2021, 53(1): 39.
Zhang Mingpeng; Huang Tao; Huang Xiaochang; Tong Xinkai; Chen Jiaqi; Yang Bin; Xiao Shijun; Guo Yuanmei; Ai Huashui; Huang Lusheng; New insights into host adaptation to swine respiratory disease revealed by genetic differentiation and RNA sequencing analyses, Evolutionary Applications, 2018, 12(3): 535-548.
童信凯; 黄路生; 艾华水; 凌紫琪; 郑浩; 李井泉; 刘梓峰; 肖石军 ; 一种直接测量动物肺体积和间 接测量肺密度的装置, 2021-8-13, 中国, ZL202022488702.2。
联系方式
目前指导硕士和博士研究生各1，欢迎广大师生交流！
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